Perchloraat is een chemische verbinding die van nature voorkomt in het milieu. Ook is het een milieuverontreiniging die met name voortkomt uit meststoffen en als afbraakproduct van waterdesinfectieproducten. Hierdoor kunnen levensmiddelen zoals groenten en fruit met perchloraat besmet raken.

De aandacht voor perchloraat als verontreiniging in levensmiddelen is relatief nieuw. In 2013 werd vastgesteld dat er gehalten perchloraat in groenten en fruit kunnen voorkomen waarbij de voedselveiligheid niet te garanderen is, hoewel er na een enkele consumptie geen sprake is van acuut gevaar. Perchloraat remt de opname van jodium in het lichaam en kan daardoor de werking van de schildklier beïnvloeden. Chronische blootstelling kan voor bepaalde bevolkingsgroepen zorgwekkend zijn.

Er zijn geen wettelijke normen, maar er zijn de Europese commissie wel referentiewaarden vastgesteld.